本发明涉及一种基于仿生控制机理的信息系统安全防护方法，所述方法包括以下步骤：步骤（1）模仿人体的高效神经控制机理，构建类神经系统控制架构，将人体神经系统的主要要素映射到信息系统中，全方位部署安全神经元；步骤（2）将功能要素与安全要素融入到基本功能模块中，构建一种以任务为导向的执行动作细粒度监控机制；步骤（3）根据任务执行条件调用基本模块执行操作，在执行过程中感知执行路径，通过反馈发现环境变化，根据策略进行校准。该技术方案通过将神经元、脊神经、人脑的元素引入到信息系统网络的各个层次中，使安全体系与系统功能实现高度融合，在系统基于功能元素模块化的基础上，以任务为导向进行细粒度的安全控制。