本发明公开了一种混群优化算法的船舶推力分配方法，包括如下步骤：(1)、根据船舶对象实际情况，进行各种参数的初始化；(2)、根据步骤(1)的参数值、前一个时刻的推力分配解以及当前需求力和力矩，运用“极尽求取”混群优化算法，获得最优解和最优子扇区；(3)、根据步骤(2)获得的最优解和最优子扇区，采取停留时间切换技术和滞后切换技术，确定一个最适合的扇区组合；(4)、根据步骤(3)选择的最适合子扇区组合，运用“极尽求取”混群优化算法，确定每个推进器的方位角和推力大小；(5)、输出步骤(4)的推力分配结果，准备下一个采样时刻的推力分配求解。本发明在降低船舶系统能耗的同时，减少推进器的磨损和避免奇异结构。