本发明公开了一种甲硫醇提纯装置，包括多级冷凝器、萃取塔、聚结器、脱气塔、甲硫醇精馏塔、甲硫醚精馏塔、废水精馏塔、甲硫醚转化反应器。多级冷凝器与甲硫醇合成反应器相连，下部气相出口与合成尾气冷凝器相连，底部液相出口与萃取塔下部相连；萃取塔与聚结器、冷凝器相连，底部出料口与废水精馏塔中部相连；聚结器与萃取塔、脱气塔、甲硫醇精馏塔相连；甲硫醇精馏塔顶部出口与硫醇储罐相连，底部出口与甲硫醚精馏塔中部进料相连；甲硫醚精馏塔与甲硫醚转化反应器相连；废水精馏塔顶部出口与尾气洗涤器相连。本装置工艺流程合理，产品甲硫醇纯度高，运行能耗低，甲硫醚利用充分，是一种理想的甲硫醇提纯装置。