本发明提出了一种药物样品的残留DNA的检测方法，所述药物为蛋白药物、细胞治疗药物或基因治疗药物，该方法包括：(1)将药物样品在蛋白酶K存在的条件下进行消化处理，所述消化处理是在TE缓冲液中进行的；(2)将消化处理产物进行灭活处理；(3)将步骤(2)的灭活处理后体系在预定的PCR反应体系中进行Q‑PCR扩增，以便获得样品残留DNA的含量。相比于现有的检测蛋白药物或细胞治疗药物或基因治疗药物DNA残留的方法，本申请的准确度得到显著提高。