本发明给出了一种基于重叠加窗的无失真信号处理方法，包括：步骤一、将待处理的数据信号功分成第一路数据信号和第二路数据信号；步骤二、采用原始窗函数对第一路数据信号进行加窗；步骤三、根据原始窗函数和预先设定的重叠比例因子，得到互补窗函数；步骤四、对互补窗函数和第二路数据信号分别进行延迟处理；步骤五、采用延迟处理后的互补窗函数对延迟处理后的第二路数据信号进行加窗；步骤六、将加窗后的第一路数据信号和第二路数据信号相加，得到无失真信号。本发明还给出了一种存储介质和系统。本发明在保证一定重叠比例下，降低了计算量，同时避免了数据信号在加窗的过程中的失真问题。