本发明主要涉及猪瘟病毒Erns蛋白亲和多肽及应用，该多肽由计算机模拟的虚拟分子对接技术设计而成，序列为WRHYIH。本发明以同源建模获得的猪瘟Erns蛋白晶体结构为模板，根据虚拟分子筛选技术，获得多肽序列P1。人工合成多肽后，采用酶联免疫吸附测定试验和等离子共振试验鉴定该序列与猪瘟Erns蛋白相互作用的亲和性，结果表明P1序列与猪瘟Erns蛋白具有较高的特异性和亲和力；本发明为以亲和肽作为亲和配基的亲和层析提供了可靠理论基础，可通过对多肽标记，从而对猪瘟Erns蛋白进行快速检测。