本发明公开了一种基于投影估计的相控阵线圈磁共振图像非均匀性校正方法，该方法包括：通过阈值法获得二值掩模图像进而得到感兴趣区域（ROI）图像，对ROI图像进行投影，采用非线性拟合的方法对投影曲线进行拟合，采用Radon逆变换的方法对拟合后的曲线进行重建得到偏场估计图像，基于低通滤波的方法对掩模和偏场估计图像进行处理并利用所设计的图像融合算法将原始磁共振图像、掩模图像、偏场估计图像融合得到非均匀性校正后的图像。通过该方法有效解决了常规磁共振系统中由于射频线圈磁场不均匀以及相控阵线圈灵敏度存在空间差异性所导致的图像灰度不均匀问题，运用所述方法对磁共振图像进行校正，结果显示校正后的图像在保证信噪比的同时大幅度提高了图像的均匀性，具有很高的临床应用价值。