本发明公开了一种具有椭圆激波器的余弦活齿减速器，属于余弦活齿减速器技术领域，包括椭圆激波器、柔轮压盖Ⅰ、柔轮压盖Ⅱ、柔性轴承、活齿架、十字交叉轴承、内齿圈和挡板；所述活齿架的齿槽内设置有推杆和活齿；所述椭圆激波器一端设置有柔轮压盖Ⅰ，椭圆激波器另一端设置有柔轮压盖Ⅱ；所述椭圆激波器外套接有柔性轴承，柔性轴承外设置有推杆，推杆与活齿连接，活齿与活齿架连接，活齿架与十字交叉轴承连接，十字交叉轴承与内齿圈连接。本发明是专为解决目前柔轮易磨损的问题设计而成，本方案彻底摒弃传统柔轮结构，创造性的利用圆柱活齿替代传统谐波减速机的柔轮，提高减速机的刚性，保证传动精度，延长减速机的使用寿命。