本发明公开了一种深地环境下岩体复杂结构面各向异性渗流试验机及测试方法，该试验机包括底座，安装于底座上的三轴渗流承载底盘，安装于三轴渗流承载底盘上的渗流组件以及用于向渗流组件施加垂向压力的加载立柱；渗流组件包括渗透压头以及与渗透压头组合使用的试件；渗透压头包括上渗流垫块、下渗流垫块以及将上渗流垫块、下渗流垫块和试件连接的若干封通器。本发明通过设置在上渗流垫块/下渗流垫块渗流通道与试件渗流孔之间的封通器，能够实现对渗流孔和渗流通道的良好密封，使得各渗流通道之间互不影响，从而能够实现同时测量岩体中复杂结构面各向异性对渗流的影响。