本发明公开了一种用于带电抗器混接线路的保护系统及方法，所述方法包括：通过在架空线路与电缆连接处增加就地传输模块，就地传输模块采集混接线路连接处的工频量并与两端线路保护模块、电抗器保护模块通信，实现各侧采样同步和重要数据交互；通过对带电抗器混接线路系统的故障区间判断，提供有效的闭重信号避免重合于永久性故障，经济实现远跳信号传输至两侧线路保护模块，从而达到电抗器故障快速隔离，实现对混接线路系统的保护。本发明可提高混接线路运行可靠性。