本发明公开了一种盾构法施工隧道穿越复合地层的地层损失率确定法，包括如下步骤：划分盾构隧道施工引起的地层损失；包括盾前地层失、盾中地层损失和盾尾地层损失三部分；加权累积计算盾构隧道穿越合地层时引起的盾前地层损失率：考虑盾壳与管片之间存在必要的建筑隙情况下，计算盾构隧道穿越复合地层时引起的盾尾地层损失；计算盾隧道穿越复合地层时引起的总地层损失率；本发明可快速获取盾构法施隧道穿越复合地层引起的地层损失率，方法简便且适用性较强；考虑多因素获取盾构法施工隧道穿越复合地层引起的地层损失率，提高了地表降的预测准确度。