本发明公开了一种低温情况下燃料电池控制方法，包括以下步骤：获取动力电池的温度、SOP和SOC；对动力电池所处温度范围、SOC及当前允许SOP进行判断，控制燃料电池启动和动力电池加热开启；当动力电池温度低于设定阈值或SOC小于设定阈值时，启动燃料电池；燃料电池输出功率根据动力电池允许功率、加热所需功率和车辆最低能耗功率进行控制。在低温环境下动力电池容量降低，且不允许充电，在动力电池可用电量有限时，进行综合分配，分别控制加热时序并对燃料电池系统输出功率进行限制使用。加快双电源系统迅速能够进入正常工作状态，使动力电池电量能够恢复到正常控制范围，避免出现过度放电的情况，车辆动力性也逐渐恢复正常。