本发明公开了一种基于自动化机械钻井用取样装置，包括转动电机组件，转动电机组件的底部活动套接有转动导向组件，转动电机组件的内部活动套装有电机轴杆，转动导向组件的底部活动套装有中轴连接组件，中轴连接组件的底部固定卡接有钻杆组件，钻杆组件的底部活动套装有钻头组件，转动导向组件的底部固定连接有导向连接轴，导向连接轴的上下两面均开设有连接卡槽，中轴连接组件包括有限位卡块和限位卡轴，限位卡轴的上下两面均开设有限位卡槽。本发明通过设置了中轴连接组件和钻杆组件等组件，利用钻杆组件等结构，增加其厚度，降低其刚性，不易被折断，防止土壤二次掉落，极大的提高了取样的效率和质量。