本发明涉及一种检测植物活性小分子的传感器和制备方法，该传感器包括：微针阵列电极，其用于检测植物活性小分子浓度；透明柔性衬底，其一侧具有固定所述微针阵列电极的凹槽；透明柔性薄膜，其固定于所述透明柔性衬底远离所述凹槽的另一侧；多个信号传导电路，其布置于所述透明柔性衬底和透明柔性薄膜间，并且每一所述信号传导电路穿过所述透明柔性衬底与所述微针阵列电极连接。本发明可以贴附于植物的叶片、茎等表面，起到传感和固定的双重功能，并且可以使得可见光透过传感器照射至植物表面。