本发明提供一株人源性发酵乳杆菌ZJUIDS06及其应用。分类命名为发酵乳杆菌Lactobacillus fermentum，保藏编号为CGMCC NO.21339。本发明菌株具有较好的体内降血脂能力的功能性乳酸菌，在高脂血症金黄地鼠模型的八周灌胃试验中能使血清总胆固醇、甘油三酯、低密度脂蛋白胆固醇均出现显著性降低。本发明菌株还具有较强的抗氧化、降胆固醇功效，具有良好的耐酸和胆盐性、培养液无抗生素耐性、抑制肠内有害的病原菌，证明该菌株具有良好的益生特性。在生产发酵蛋酸奶及蒙特里杰克干酪中应用时均能显著降低产品中的胆固醇含量，可制备降血脂、降胆固醇及抗氧化等功能益生产品。