本发明公开了一种基于GCN和NSGA‑Ⅱ的水库调度多目标优化方法，包括：搜集水库防洪调度相关数据，建立防洪多目标优化模型；使用NSGA‑Ⅱ得到初代种群，通过编码操作对个体进行分组，分组后的类别作为GCN的节点，将交叉、变异操作得到的父子代关系映射为GCN节点之间的边；使用NSGA‑Ⅱ获得初步pareto前沿，对其横坐标进行分组标签化，再利用该分组标签和步骤二得到的图结构训练GCN模型；利用训练好的GCN模型对图结构的节点进行分类，再使用NSGA‑Ⅱ调节pareto前沿的均匀度；根据NSGA‑Ⅱ调节后的pareto前沿，输出水库调度多目标优化问题的非劣方案集。本发明可广泛应用在多目标水库优化调度上，快速给出满足所有目标的水库优化调度方案。