一种穿行式管廊衬砌系统，包括模板系统、拖行转运系统、顶部行车系统；模板系统包括仓内模板和仓外模板，仓内模板包括顶模、上边模、下边模，管廊两侧的仓外模板与管廊两边墙的边模固定连接，邻仓对应的边模之间固定连接，顶模的两端分别与其两侧的上边模铰接，顶模两端分别与对应的上边模通过液压丝杆定位，上、下边模铰接，下边模通过撑地丝杆定位，管廊两侧的仓外模板之间固定定位；拖行转运系统包括驱动行走机构、平移机构、升降机构、收放模板机构、对位报警机构、中部钢轨转运机构；顶部行车系统主要有驱动行走系统、龙门架、行车葫芦。采用该衬砌系统不仅能够提高混凝土的衬砌质量，而且等强等待时间短、施工效率高。