本发明公开了一种包埋维生素E和藻油的微乳液和微胶囊及其制备方法。该方法包括：将维生素E、藻油与β‑环状糊精溶于液体油脂中，作为芯材材料；将OSA淀粉溶于水中，制成包材溶液，预乳化，进行二段的均质处理；均质处理后的物料，脱气，流加壳聚糖包材辅料，溶解分散壁材辅料及麦芽糊精等配料，得到微乳液产物；或者将二段均质处理后的物料，搅拌溶解DE值8.0～12.0的麦芽糊精等配料，提高体系干固物含量，真空脱气，喷雾干燥得到微胶囊。该方法利用植物油脂溶解分散VE和藻油，VE的存在使得共存的藻油稳定，再用环状的β‑环状糊精进行分子的包埋。该微乳液耐热、耐候性好和稳定保质期长；微胶囊VE包埋率高。