一种金属矿微波‑机械流态化开采系统及开采方法，包括微波预裂机械采矿系统、微波分离系统、高功率微波聚焦熔化系统及采空区；通过微波预裂采矿系统采下的矿‑废混合体通过其上的输送机Ⅰ和提升机运输到微波分离系统，分离出的矿石运输到高功率微波聚焦熔化系统，分离后的废石通过输送机Ⅴ运输到采空区充填。采用了微波预裂机械采矿，代替传统的爆破采矿方法，提高了掘进速度，避免了爆破对围岩稳定的影响。简化了选矿的工艺，减少了传统破碎、磨矿、浮选的工序，大幅降低了对钢材、化学溶液等不可再生资源的消耗，主要采用的微波能量可以通过可再生能源转化。