本发明涉及植物杂交种预测方法技术领域内一种基于贝叶斯模型整合亲本表型的杂交种预测方法，首先对亲本材料进行基因分型和田间表型鉴定，并由亲本基因型推断出杂交种基因型；构建杂交种训练群体并进行田间鉴定；建立整合亲本表型的BayesB模型，对杂交种表型进行预测，采用十倍交叉验证对该模型的准确性进行评价。本发明的杂交种表型预测方法中，通过构建贝叶斯模型整合亲本表型的杂交种预测方法来预测杂交种表型数据，从而提高杂交种预测的准确性，进一步提高育种效率，降低成本，并对提高作物产量等相关性状的准确预测提供了理论参考和实践依据。