本公开提供了一种基于自适应MPPT的光伏系统间谐波抑制方法及系统，所述方案通过在对光照强度变化方向的判断当中引入光伏输出电流变化量，并结合传统MPPT算法形成自适应MPPT算法以准确判断光照强度变化，进而实现准确无飘移的追踪最大功率点；同时，所提自适应MPPT算法以MPPT算法输出的直流链电压参考值为输入变量，判断其值是否连续三次满足三点周期振荡特性，若满足表明追踪到新的最大功率点，系统则将扰动步长置为零，随之，进行在最大功率点的恒电压追踪，从而减少了在最大功率点附近的扰动；反之，依旧扰动追踪新的最大功率点。最后利用仿真验证所提抑制策略可以在保证MPPT效率的同时有效减少间谐波的注入，提高了电能质量。