本发明提供一种心音分类识别方法及系统，属于心音识别技术领域，使用全识别模型对采集的心音信号进行分析，确定心音信号是正常心音信号还是异常心音信号；根据全识别模型的识别结果，将心音信号输送至第一识别模型或第二识别模型，若第一识别模型或第二识别模型的识别结果与全识别模型的结果一致，则识别结果为全识别模型的识别结果；若不一致，则基于深度度量学习对心音信号进行分析，确定心音信号是正常心音信号还是异常心音信号。本发明将阴性数据和阳性数据分离开各自形成新的数据集合，分别对分类器模型进行训练，得到单一型数据模型，进而集成出一种新的分类器应用结构，进行分类结果进一步的判断甄别，提高了集成模型整体的分类准确率。