本发明涉及一种天然气水合物井下旋流排序分离装置，属天然气水合物开采技术领域。该旋流排序分离装置由外管和内管构成，外管内通过间隔设置的固定板安装有内管，内管的内壁上焊接有旋流分离器。该旋流排序分离装置能实现天然气水合物与泥砂颗粒的排序，且能对天然气水合物与泥沙进行原位分离，从而能获得更加纯净的天然气水合物，且能有效提升开采效率，大大降低开采成本；通过排砂孔9能将泥沙重新排放至海底，从而能使泥沙回填，进而保证开采时的安全性和可靠性；解决了现有开采方式开采成本高，安全性和可靠性差的问题，特别适用于天然气水合物的开采使用。