本发明涉及一种发电机组燃油加温启动控制系统及其方法，包括燃油供给管、增压泵、承载机架、承载托架、换热管、空气涡流管、增压风机，承载托架与承载机架上端面连接，换热管嵌于承载机架内，燃油供给管包覆换热管外，且其至少一端与增压泵连通，空气涡流管嵌于承载机架内，且空气涡流管进气端通过增压风机与换热管排气口连通。其使用方法包括系统装配，运行参数设定及预热发电等三个步骤。本发明一方面可有效满足与多种发电机组设备配套使用的需要；另一方面在有效实现对燃油进行预热作业的同时，另可有效的对发电机组进行的降温调温，且温度调节作业运行能耗低，设备运行及维护成本低廉，难度小。