一种DNA自索引区间解压缩方法，它属于DNA压缩数据的解压缩技术领域。本发明解决了现有的解压缩算法需要的解压缩时间长，且解压缩后的数据需要的存储空间大的问题。本发明的自索引区间解压缩算法可以根据需求来选取解压缩的范围，相对于全局静态TPBWT解压缩算法来说，很大程度的降低了解压缩时间，同时也降低了解压缩数据的存储空间。相对于传统解压缩算法，该算法更加灵活能够依据不同需求，解压缩出不同含义的数据，适用性更强。本发明可以应用于对DNA压缩数据的解压缩。