本发明公开了一种电热综合能源系统的两阶段优化调度方法，属于综合能源系统经济调度技术领域。首先建立包含电热替代型负荷在内的综合需求响应模型，并定义机组波动评价指标，将它们应用到上下层两阶段优化调度过程中。在上层优化调度阶段，以风电消纳最大为目标，建立功率平衡关系式和目标函数。在下层优化调度阶段，以系统煤耗量最小为目标优化设备出力，建立功率平衡关系式和目标函数。并通过改进的粒子群算法求解上下层两阶段优化调度过程中的待优化变量。该方法充分利用了综合需求响应和储能装置发挥其调度灵活性，在提升系统的调峰能力和风电消纳率的同时平滑机组出力，相较于传统的为消纳风电而频繁的调整机组出力更有利于系统的稳定运行。