本发明公开了一种可胃肠道递送的颗粒型益生菌制备装置，涉及益生菌食品生产领域，包括双螺杆挤压机，其包括机体、支撑装置、加料搅拌装置、挤压装置、包衣装置、切割出料装置及控制装置；加料搅拌装置包括锥型进料腔、进料口、搅拌轴等；挤压装置包括输送绞龙，其四周设置为物料移动腔；所述包衣装置包括模头，模头上设置有渗透孔，包衣段上部设置有包衣液箱和压力泵；切割出料装置包括切割刀具，其下方设置有接料台。本发明还公开了一种可胃肠道递送的颗粒型益生菌制备方法，其步骤包括液化油脂、混合其他原料、加工成品。本发明对原料搅拌后挤压成型并包衣处理，之后自动切割出料，其可灵活调整成品的大小形状，且可流水线大规模生产。