本发明涉及一种隧道早晚通风控制系统及方法，包括区间隧道通风系统和变频控制系统，变频控制系统包括控制器、变频器和人机交互界面，人机交互界面与控制器连接，控制器与变频器连接，变频器与区间隧道通风系统的隧道风机连接，人机交互界面用于供操作者进行早晚隧道风量及运行时间的设定，并将设定的信息传递给控制器，所述控制器根据风量与频率的关系，计算出隧道早晚通风时在给定时间t所需风机运行频率f，在早晚通风工况下，变频器控制隧道风机以计算频率f进行通风，运行t小时后控制隧道风机停止运行。本发明根据用户设置早晚通风风量及运行时间，自动调整风机运行频率，控制风机运行，保证通风需求的同时，尽量减少通风能耗。