本申请公开了一种配电网站域式快速保护系统及方法，系统包括：站域式保护装置、馈线终端、交换机；站域式保护装置通过交换机与馈线终端相连；站域式保护装置和馈线终端均遵循IEC61850标准；馈线终端用于采集并发送站外馈线的故障信息、开关量信息、运行信息到站域式保护装置；并根据保护指令对出线开关和馈线开关进行控制；交换机用于根据传输数据的类型设置传输优先级，并根据优先级控制馈线终端与站域式保护装置的数据交互；站域式保护装置用于对馈线进行拓扑动态识别，同时根据运行信息和故障信息通过高容错性集中式保护算法，生成保护指令发送到馈线终端。解决了现有技术不能同时兼顾响应速度快且运维工作量少的问题。