本发明涉及一种用于提取核酸和PCR检测的微流控芯片及其应用。微流控芯片核酸提取反应仓、纯化反应仓和PCR反应仓，核酸提取反应仓和纯化反应仓的前端均连接有带有两分支进液仓，后端连通一个取液仓，PCR反应仓前端连通一个三分支进液仓，后端连通一个取液仓。核酸提取反应仓、纯化反应仓可制成一个芯片，PCR反应仓在另一芯片上，PCR反应仓可设有一个或多个。本发明提供的用于提取核酸和PCR检测的微流控芯片，有效的将提取核酸的步骤及纯化过程与PCR扩增反应有效结合起来，实现全密封式操作，避免二次污染，保证实验结果的可靠、真实、有效。