本发明公开了一种高纬度林区岛状冻土路基结构及施工方法，本发明将填筑的1m厚的片块石冲击碾压至地平线以下，在其上方再填筑50cm厚的片块石层，随后铺设两布一膜，再填筑50cm厚的砂砾下垫层，在其顶层铺设一道反滤土工布后填筑1m厚的砂砾上垫层，在路基两侧各设置一排热棒结构，并设置护坡道及排水沟。本发明能调节、维护高纬度林区冻土路基内部的水热交换平衡条件，减小冻土融化幅度及冻土路基发生的不均匀变形，提高路基结构的稳定性，延长道路的使用寿命，降低道路后期维护的费用。