本发明公开了一种海上风机阵列输出指令控制方法、系统、装置及存储介质，所述海上风机阵列输出指令控制方法，包括步骤：计算目标风机t‑1时刻的叠加风速；依据t‑1时刻目标风机的叠加风速，结合t‑1时刻目标风机的功率输出指令、t‑1时刻目标风机的风速，计算出t时刻目标风机的功率输出指令；输出该t时刻目标风机的功率输出指令，用于控制目标风机t时刻的功率输出。本发明提供的海上风机阵列输出指令控制方法，以基于目标风机和相邻风机风速、距离的多尺度评价体系，自主建立适用于当前应用环境的风机输出指令值。既让风电机组场站整体进行最合理的功率分配，又通过风速叠加的方式兼顾了单个风机的功率输出预测。