本发明公开了一种LED芯片结构、其制备方法以及显示模组，LED芯片结构，包括依次层叠的N型层、量子肼有源层和P型层，所述LED芯片结构还设有若干孔结构，所述孔结构依次贯穿所述P型层和所述量子肼有源层，直至所述N型层内部，所述孔结构内设有量子点，所述量子点位于所述孔结构的底部，所述量子点与所述N型层直接接触且所述量子点不与所述量子肼有源层直接接触。本发明通过将量子点仅填充至N型层内部，将量子点与量子肼有源层和P型层均不直接接触，避免P型层升温对量子点性能的影响。