本发明属于分子生物学领域，具体涉及一种富硒酵母基因工程菌及其表面展示系统及其构建方法。将酵母基因工程菌使用培养基培养，然后添加亚硒酸钠继续培养得到富硒酵母基因工程菌。将山羊γ‑干扰素插入His标签，以pYD1穿梭质粒为骨架，构建pYD1‑CapIFN‑γ；然后将pYD1‑CapIFN‑γ导入至富硒酵母基因工程菌获得山羊γ‑干扰素富硒酵母展示系统。该系统对其中的酵母进行富硒改造，拓宽了山羊γ‑干扰素酵母表达系统的应用范围；且实现了山羊γ‑干扰素的酵母表面展示，更有利于其抗病毒活性的发挥；为研发更安全、有效、廉价的具有抗病毒与增强机体免疫力的新型酵母饲料添加剂奠定基础。