本申请公开了一种传导电磁干扰测试方法及系统，传导电磁干扰测试方法包括：时域波形采集步骤：测试被测端口的电流与电压，并采集所述电流与所述电压的时域波形；干扰分量计算步骤：通过所述电流与所述电压计算共模干扰分量与差模干扰分量；频域转换步骤：根据所述共模干扰分量与所述差模干扰分量，将所述电流与所述电压的所述时域波形转换成所述共模干扰分量与所述差模干扰分量的频域频谱。本发明未隔离电源端和负载端的传导电磁干扰，测试结果真实地反映了被测端口的总的传导电磁干扰水平，适用于绝大多数实际应用现场的测试要求，具有较高的普适性。