本申请涉及日本蟳群体行为视频分析技术，公开了一种基于实例分割的日本蟳群体行为视频分析方法，包括：步骤一、生物暂养与视频采集；步骤二、实例分割数据集建立；步骤三、日本蟳整体分割和头胸甲分割模型的建立；步骤四、日本蟳整体分割、头胸甲分割及ID号判断；步骤五、日本蟳运动能力和接触度评估。本发明方法可有效解决因日本蟳个体接触而带来ID难以预测的问题，为包括日本蟳在内的类似蟹类群体行为研究提供视频分析方法，且准确率满足行为学研究的需要，具有非常大的实用价值和产业应用价值。