本发明公开了一种有机硅细胞涂层的制备方法，利用菌体表面为模板，通过3‑氨丙基三乙氧基甲硅烷(APTES)与菌体表面的活性基团反应及其自身的缩聚，在菌体表面形成一层有机硅，有机硅涂层能有效保护菌体结构不被破坏，提高菌体本身及胞内蛋白的稳定性。优选地，在加入3‑氨丙基三乙氧基甲硅烷(APTES)前加入正硅酸乙酯(TEOS)，通过正硅酸乙酯(TEOS)水解形成的氧化硅颗粒结合3‑氨丙基三乙氧基甲硅烷(APTES)对氧化硅颗粒的修饰作用，使菌体表面的有机硅涂层中增加了氧化硅颗粒，使有机硅涂层维持细胞及其胞内蛋白稳定性的能力更加显著。本发明制备原料廉价、易得，制备工艺简单易行，适用于工业生产。