本发明公开了一种利用脐针治疗幻肢痛的分析方法，包括以下具体步骤：第一步、在进行脐针治疗前，通过生理测试和监测系统，生成幻肢痛治疗方案；第二步、根据幻肢痛治疗方案，通过脐针穴位定位系统，精确控制进针位置，完成脐针的进针；第三步、脐针针刺结束后，获取第三次生理电信号；将第三次生理电信号与第一次生理电信号进行比较分析。脐针穴位定位系统，包括机架，机架上设有定位机构，定位机构下方设有进针位置指示盘；所述机架上还设有控制器，控制器连接有摄像头和红外距离传感器，且定位机构与控制器相连；所述摄像头和红外距离传感器均嵌设在定位机构的下表面。本发明具有能够有效减少人为因素对治疗效果干扰的特点。