本发明公开了一种燃料电池的减震装置及其控制方法，属于燃料电池减震技术领域。该装置包括减震底板、燃料电池安装板、竖直设置的电控阻尼弹簧减震器，五个电控阻尼弹簧减震器对燃料电池安装板底部形成均匀支撑并及时将燃料电池安装板复位，燃料电池底板上端周向设有四个定位块，限制燃料电池的水平位置，防止燃料电池水平移动。所述控制方法通过震动感应器感应到路面震动信号和水流量计采集到燃料电池的水流量，都将采集到的信息传送给控制器，控制器根据路面震动的变化以及水流量的变化所反馈的信号控制电源大小，调节阻尼力大小，改变减震装置的减震强度，提高燃料电池的减震效果。