本发明公开了一种叶绿素原位检测装置，包括：外壳，其内部限定有容纳腔，外壳的一端开设有安装口；端盖，其设置在所述安装口处，与外壳密封固定，端盖的下表面开设有装配孔；电路板，其固定在容纳腔中；光学组件，其密封固定在装配孔中，且光学组件的光收发面朝向容纳腔的外侧，光学组件通过通信线与电路板连接；电刷组件，其与电路板电连接，用于清洁光收发面的外表面。本发明的叶绿素原位检测装置，通过设置电刷组件，其可受控清洁光收发面的表面，防止海洋生物的附着以及海洋垃圾的贴附，保证用于检测叶绿素浓度的光学组件的采集面的清洁，进而可对外部信号连续、可靠的进行原位采集。