本发明涉及碎云条件下序列遥感图像舰船目标跟踪方法、装置及设备，属于卫星数据处理技术领域，该方法基于预设卫星，获取遥感序列图像，并对所述遥感序列图像进行预处理和检测，得到舰船目标；基于所述舰船目标，根据高精度海岸线数据和AIS数据对舰船目标位置进行联合定位和校正，获取所述舰船目标的物方坐标；根据所述舰船目标的物方坐标，进行舰船目标跟踪，建立舰船目标模型，使用基于中分纬度航法的地理坐标转移方程，采用PDA框架进行航迹滤波，完成多帧关联与航迹提取，获取所述舰船目标轨迹。本发明中，可基于实测数据，直接对遥感图像舰船目标进行跟踪，降低了碎云条件下舰船目标的虚警率，提高了目标跟踪的准确率。