一种具有中转箱的真空集便系统及操作方法，包括座便器，座便器通过排污管与污物箱连接，污物箱上设置有抽真空排气管；座便器还通过连接管安装气水操作系统，气水操作系统通过总管连接水箱；还包括控制单元，控制单元与气水操作系统、座便器、污物箱电信号连接，控制单元还连接有冲洗按钮；通过在座便器内配备中转箱，并在气水操作系统、污物箱的配合工作下，可以方便的完成低噪音的集便工作，工作可靠性好，工作效率高，响应速度快。本发明在满足乘客如厕的情况下，可以降低包间内的噪音，避免较大的噪音影响乘客的休息提高乘客出游的满意度。同时该真空集便系统带有一个中转箱，可以减少真空发生器的启动频次，减少对压缩空气的消耗，降低列车的功耗。