本发明涉及杂草生物防治领域，公开了一种藤仓镰刀菌、含有该菌的菌剂和除草剂及它们的应用。具体地，本发明提供了一株藤仓镰刀菌，其中，所述藤仓镰刀菌(Fusarium fujikuroi)的保藏编号为CGMCC No.21038。本发明还提供了含有上述藤仓镰刀菌的菌剂和除草剂。本发明提供的藤仓镰刀菌、菌剂和除草剂可用于农业生产上防治禾本科杂草和阔叶杂草。本发明的藤仓镰刀菌对杂草的致病力较强，成分简单，环境友好，施用简单，杀草谱较广，具有进一步开发成生物除草剂的潜力。