本发明公开了GhMYB44基因在棉花愈伤组织分化发育中的应用，属于转基因技术领域。本申请通过超表达GhMYB44基因，使中棉所24植株外植体7d形成层中细胞结构发生了重组、30d愈伤组织的细胞呈现小而圆的特征、45d愈伤组织的有类似胚性愈伤组织细胞团出现，这些表型说明该基因能够促进受体材料更快从愈伤组织分化为胚性愈伤组织，加快再生苗进程，从外植体得到再生苗时间仅需182d，比对照缩短了24.7％，为棉花基因转化和快速育种做出贡献。