一种可靠的多源轨道外推自主选用方法，包括如下步骤：(1)在轨道计算任务中维护N+1组轨道数据，N为多源轨道外推中的N源，1为选用的轨道数据，多源轨道计算串行进行，最后进行结果融合；(2)对多源轨道外推的数据源进行有效性验证，为实现初次引入源轨道数据和两种轨道外推间的无缝切换，进行可变的数据有效性验证；(3)GNSS轨道外推与自主导航进行自主切换。本发明实现了基于缺省选用、指令使能、指令选用、无缝切换、自主切换的自主选用方法。很好地支持了地面站优先、初次引入源轨道数据、星上长期自主运行等不同轨道使用需求，有效提高了卫星的自主运行能力。