本发明公开了一种基于深度局部特征匹配的批图像配准方法，包括以下步骤：步骤S1、建立图像校准模型，通过对图像校准模型的训练得到一批校准后图像；步骤S2、通过图像配准评估方法为该批次图像打分，并选择超过阈值的最好图像作为模板辅助精确校准过程；步骤S3、计算模板图像和待配准图像若干深度特征点之间的匹配关系；步骤S4、通过RANSAC检验并排除错误匹配点，并得到两幅对应图像之间的仿射变换关系矩阵；步骤S5、通过相对位姿变换关系得到配准后图像，进行图像增强处理后输出校准结果。对批数据的配准需求，我们将图像匹配方案与图像矫正结合，通过一种判断矫正质量的方案自适应进行两个阶段的匹配，并获得较好的匹配效果。