本发明涉及当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎作用机制的研究方法。通过TCMSP和uniprot等数据库分析获得活性成分与疾病的交集靶点。基于String构建蛋白质‑蛋白质相互作用(PPI)网络，应用Cytoscape软件对结果进行可视化分析PPI网络中的重要模块和核心靶点。采用Metascape对靶点进行基因GO和KEGG通路富集分析，获得成分‑靶点‑基因功能‑通路‑疾病的可视化图形，并对作用机制解析。本方法为研究当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎的药物‑靶点相互作用机理提供了新方法；解决了多活性成分和多靶点蛋白之间相互作用的数量太大，难筛选的难题，对于指导中药复方的研发具有重要的应用意义。