本发明公开了一种抗干扰通信方法及系统，其中，发射端发射的帧同步信号包括两段相同的子同步信号；通过帧同步信号中两段子同步信号的时间差和频率差信息来携带发射端发送数据信号的通信参数，使得接收端易于从接收到的帧同步信号中识别到对应的通信参数，来接收数据信号；大大扩充了帧同步信号的使用范围，使其不仅适用于如定时同步、频率同步等的一般同步，还能提供数据通信的中心频率和编码调制参数，使得本发明仅通过帧同步参数即可实现在通信的发送方切换到干净的通信参数后，通信的接收方能够灵活知晓新的通信参数，进而实现抗干扰通信。另外，本发明中发射帧同步信号和发射数据信号的参数可以不同，可以支持大频率范围的频率切换以抗干扰。