本发明公开了一种高抗性淀粉含量谷物饮料的制备方法，包括以下步骤：将藜麦粉与纯净水搅拌后静置，将所得的藜麦粉浆状物加酸调节pH至4.5～5.5，于50℃～54℃、100～200转/分钟搅拌16～36小时，得韧化处理后藜麦粉浆状物；然后加入纯净水打浆，所得的藜麦浆液中加入甜味剂、乳化剂，均匀混合，得到藜麦乳液；将藜麦乳液均质后灭菌、包装，得高抗性淀粉含量藜麦谷物饮料。本发明经韧化处理，提高了藜麦淀粉的抗性淀粉含量，降低了藜麦淀粉的消化速率，有利于糖耐量缺陷或糖尿病人的血糖管理。