本发明涉及超浅覆土大直径盾构下穿河流反压防护结构的施工方法，包括步骤：1)双壁钢管桩施工；2)冠梁开挖；3)河道防护；4)砂袋制作；5)首层砂袋就位；6)填抛砂袋；7)砂袋支撑；8)沙箱就位；9)隧道注浆；10)施工面恢复。本发明的有益效果是：本发明所涉及结构可解决施工条件受限的隧道浅埋段盾构施工难题，施工时对周围建筑地基扰动较小，具有较好的技术效益；河床底部设置河底注浆加固区，两侧设置纤维袋注浆锚杆，隧道顶部设置隧道注浆加固区，可提高淤泥土的承载力；砂袋抛填时两侧设置台阶，底部设置混凝土封底，砂袋上设置砂袋追踪器，有利于砂袋整齐就位。